デビュー年：２００６年
運転区間：高徳線、徳島線、鳴門線、牟岐線
ＪＲ四国がキハ５８系を置き換えるために製造したステンレス車体、両運転台の車両で、徳島地区に投入。
最高速度は１０００系と同じく１１０ｋｍ／ｈで、地球環境に配慮した環境対応型エンジンを搭載することで窒素酸化物の排出量を削減した（１０００系と比べて６０％カット）。これを意識したか、外観では従来のＪＲ四国標準タイプの塗装から一新し、自然の景観をイメージした緑色をベースにしたものを採用。
ドアは片開き３扉で、床面を低くすることにより出入り口のステップレス化を達成。また、車内腰掛は転換式クロスシートを採用し、補助座席も用意されている。さらに、車椅子対応のトイレも用意されている。
１０００形との連結も可能だが、連結器が異なるため一部の１０００形が対応型に改造されている。
